A proteomika megtalálja a megfelelő terápiás célpontokat

A fájl összefoglalása

A genomika után itt van a fehérjék szisztematikus vizsgálata. Ez lehetővé teszi a betegség markerek és terápiás célok felfedezését.

1995-ben, amikor az ausztrál posztdoktori munkatárs, Marc Wilkins először beszélt a proteomról (mint például a sejtek fehérje halmaza), fogalma sem volt arról, hogy egy teljesen új tudományt vezet be.
Ma azonban a proteomikát tartják a legígéretesebb biotechnológiai projektnek. És ez abban az időben, amikor az emberi genom visszafejtése majdnem befejeződött.

"A proteomika egy gén expressziójának késztermékének, nevezetesen a fehérjének a tanulmányozását jelenti" - magyarázza Jérôme Garin, a CEA grenoble-i fehérjekémiai laboratóriumának igazgatója.

Betegségjelzők
Ez a tudományág egy adott környezetben lévő sejt összes fehérjéjének számszerűsítésében és azonosításában áll. Egészséges és beteg minták fehérjéinek összehasonlításával megállapíthatjuk, hogy melyik specifikus egy patológiára. Ezek a fehérjék ezután a kérdéses betegség markereivé válnak, az új diagnózisok alapjául szolgálnak. De ezek a patológiák elleni jövőbeni gyógyszerek lehetséges célpontjai is.

Az egyik első biotechnológiai vállalat, amely kifejlesztette a proteomika fogalmát, az Egyesült Királyságban székhellyel rendelkező Oxford GlycoSciences volt (lásd I&T # 805). Először az Oxfordi Egyetemmel partnerségben: körülbelül ötven specifikus rákfehérjét fedeztek fel. Ezután a legnagyobb gyógyszeripari csoportokkal.
A programon 1998 óta: az Alzheimer-kórra és az érelmeszesedésre (Pfizerrel), asztmára és más tüdőbetegségekre (Bayerrel), cukorbetegségre (Merck-vel) és rákos megbetegedésekre (Incyte-vel) kapcsolatos fehérjék keresése.

Ne feledje, hogy az OGS növényi proteomikát is fejleszt. A Pioneer Hi-Breddel (Du Pont de Nemours csoport) a partnerség célja a növénynövekedéssel összefüggő fehérjék, különösen a kukorica azonosítása.

Határozzon meg több száz fehérjét naponta
A proteomika főként két analitikai technikán alapszik: kétdimenziós elektroforézison és tömegspektrometrián. A 2D gélelektroforézis az elektromos töltés és a molekulatömeg alapján elválasztja a fehérjéket az oldatban lévő keveréktől. Végül a gélen vizualizált foltok (radioaktív festéssel vagy jelöléssel, fluoreszkálóval) különböző fehérjét tartalmaznak. "Így több mint ezer fehérjét lehet elemezni egy 2D-s elektroforézis gélen" - mondja Jérôme Garin, a grenoble-i CEA-tól.

Miután elválasztották, a fehérjéket tömegspektrometriával azonosítják. Ez a technika komolyan felgyorsítja a kutatók feladatát. Korábban napi egy vagy két fehérjét azonosítottak kémiai szekvenálással (Edman-módszer). A Maldi TOF (Matrix assisted laser desorption-Time of flight) típusú tömegspektrométernek köszönhetően naponta több százat tudnak jellemezni.

Az ilyen típusú készülékek fő gyártói a Perkin Elmer Biosystems (amely tavaly márciusban létrehozott egy proteomikai kutatóközpontot), az Amersham Pharmacia Biotech, a Bruker és a Micromass.

Az elv: az elektroforézis gélen azonosított fehérjét enzim hatására peptidekké vágják. A spektrométer megméri ezen peptidek tömegét, és egy "tömegpeptid-térképet" ad, amelyet elegendő összehasonlítani egy adatbázissal a fehérje azonosításához. (Az amerikai Proteome vállalat ebben az összefüggésben emberi, állati és mikroorganizmus-proteombankokat kínál).