Insig2-változatok, étkezési szokások és anyagcsere-kockázat Szamoa - European Journal of
- Témák
- Absztrakt
- Háttér/célok:
- Témák/módszerek:
- Eredmények:
- Következtetések:
- bevezetés
- Anyagok és metódusok
- Vizsgálati populáció
- Adatgyűjtés
- Genotipizálás
- Adatelemzés
- Eredmények
- Vita
- További információ
- Word dokumentumok
- Kiegészítő 1. táblázat
Témák
- A betegségek genetikája
- Genetikai asszociációs vizsgálat
- Metabolikus szindróma
Absztrakt
Háttér/célok:
Az inzulin által indukált 2-es génvariánsok (INSIG2) és az elhízás összefüggését számos, de nem minden, utólagos vizsgálatban megerősítették. A populációk közötti környezeti tényezők közötti különbségek elhomályosíthatnak bizonyos genetikai asszociációkat, ezért meg kell vizsgálni a gén-környezet kölcsönhatásokat. Feltételeztük, hogy az étkezési szokások és a metabolikus szindróma összetevői közötti kapcsolatot megváltoztathatják az INSIG2 variánsai .
Témák/módszerek:
Hosszúságú vizsgálatot végeztünk az adipozitás kockázatáról és a szív- és érrendszeri betegségek kockázatáról 427 és 290 felnőttnél Szamoa és Amerikai Szamoa (1990-1995) között. Az élelmiszeripari termékek fő összetevőinek elemzését validált élelmiszer-gyakorisági kérdőív alapján alkalmazták a modern és a nem hagyományos étkezési szokások azonosítására. Feltártuk a gén-diéta kölcsönhatásokat az rs9308762 és rs7566605 INSIG2 variánsokkal.
Eredmények:
Ennek a tanulmánynak az volt a célja, hogy a főkomponens-elemzés segítségével levezesse a szamoai lakosság étkezési szokásait és értékelje az anyagcsere-egészséggel való kapcsolatukat annak érdekében, hogy megismételje a 2002 és 2003 közötti populációban korábban megfigyelt összefüggéseket, és először értékelje hogy az INSIG2 változatok (rs9308762 és rs7566605) módosítják-e ezeket az asszociációkat. A négy INSIG2 variáns között, amelyet korábban ebben a vizsgálati populációban genotipizáltunk, az rs9308762-re összpontosítottunk korábbi tanulmányunk 32 miatt, amely összefüggést mutatott a BMI-vel és a derék kerületével, valamint az rs7566605-re, a témával kapcsolatban elvégzett számos korábbi vizsgálat miatt. nukleotid polimorfizmus (SNP) más populációkban. 5., 6., 7., 8., 9., 10., 11., 12., 13., 14., 15., 16., 17., 18., 19., 20., 21., 22., 23., 24., 25., 26., 27., 28., 29., 30, 31
Anyagok és metódusok
Vizsgálati populáció
A vizsgált populációt 25–55 éves felnőttek és négy szamoa származású nagyszülő alkotja. Ennek a longitudinális vizsgálatnak a részletes leírásáról már beszámoltunk. 42, 43 Röviden: a résztvevőket 1990-ben Amerika-Szamoa 46 faluból és helyszínről, 1991-ben pedig Szamoa (akkori nyugati) kilenc faluból toborozták, majd 4 évvel később, 1994-ben, illetve 1995-ben. A kiinduláskor nem minden résztvevőnek volt kórelőzményében szívbetegség, magas vérnyomás vagy önjelölt cukorbetegség. Kezdetben 563 és 694 embert toboroztak Amerikai Szamoa-ban 1990-ben és 1991-ben Szamoa-ban. 1994-ben és 1995-ben, amikor kimeneti adatokat gyűjtöttek, 361, illetve 560 ember állt rendelkezésre nyomon követésre négy év után Amerikai Szamoa és Szamoa területén.
Minden résztvevő tájékozott beleegyezést kapott. Az összes vizsgálati protokollt a Providence-i Miriam Kórház (RI), az Amerikai Szamoa Egészségügyi Minisztérium és a Szamoa Egészségügyi Minisztérium Humán Tárgyak Ellenőrző Bizottsága hagyta jóvá.
Adatgyűjtés
Genotipizálás
Az INSIG2 28 kb méretű régióját átfogó négy tag SNP-ből, köztük az rs7566605-ből, genotipizálási adatok már rendelkezésre álltak ennek a vizsgálati populációnak. 32 A genotipizálás részletei megtalálhatók Deka et al. 32
A korábban genotipizált és elemzett négy SNP-ből (rs756605, rs1352083, rs2161829 és rs9308762) csak az INSIG2 3. intronjában található rs9308762 társult a BMI-vel és a derék kerületével a Samoa által vizsgált populációban. 32 Ezért a modell-diéta kölcsönhatások fő elemzését erre az SNP-re összpontosítottuk. Azonban az rs7566605 genetikai és étrendi modellek közötti lehetséges kölcsönhatásokat is megvizsgáltuk, vagyis az elhízáshoz kapcsolódó SNP-t más populációk genomtársulási vizsgálatai során, feltételezve, hogy a környezeti expozíció különbségei elfedhetik a genetikai asszociációkat. Az rs9308762 és rs7566605 esetében az R2 és D 'értéke 0, 37, illetve 0, 95, amint azt korábban jeleztük. 32 genotípus frekvencia Hardy-Weinberg egyensúlyban volt.
Adatelemzés
Nincsenek genetikai különbségek a szamoaiak és az amerikai szamoaiak között, és genetikailag egy és ugyanazon homogén populációnak tekinthetők a populáció alstruktúrájának bizonyítéka nélkül, amint azt korábbi tanulmányaink is mutatják. 32, 44, 45 A két ország között azonban jelentős gazdasági különbségek vannak. Mivel ezek a gazdasági különbségek a táplálkozási átmenet különböző szakaszaiban tükröződnek, úgy döntöttünk, hogy feltárjuk az országos rétegződés fő céljait.