A Covid-19 genomelemzés feltárja a Health Magazine vírus kettős eredetét
Covid-19: A genomelemzés a vírus kettős eredetét tárná fel
A Covid-19 járványért felelős SARS-CoV-2 vírus számos genetikai elemzés tárgyát képezi az egész világon annak megértése érdekében.
Néhány hét leforgása alatt mindannyian sok mindent megtudtunk, de jó néhány pletykát is hallottunk a Covid-19 betegségről és a felelős vírusról: SARS-CoV-2. Míg a vírusról szóló tudományos cikkek száma folyamatosan növekszik, a vírus eredete még mindig sok szürke területet tartalmaz.
Milyen állatfajokban jelent meg? Denevér, pangolin vagy más vadvilág? Honnan jött ? Egy barlangból vagy erdőből a kínai Hubei tartományban vagy másutt ?
2019 decemberében az első 41 kórházba került ember közül 27 (66%) áthaladt egy piacon, Wuhan város szívében, Hubei tartományban. De a járvány eredete valószínűleg nem kapcsolódik az ezen a piacon élő élő vagy elhullott állatokkal való érintkezéshez, mert a wuhani kórházban végzett kínai tanulmány szerint úgy tűnik, hogy a legelső azonosított emberi eset nem látogatta meg ezt a piacot.
Ezzel a hipotézissel egyetértésben a SARS-CoV-2 genomi szekvenciáiból becsült molekuláris datálás inkább novemberi eredetet jelez. Ezért jogosak vagyunk arra, hogy rákérdezzünk a Covid-19 járvány és az élővilág közötti kapcsolatra.
Amit a betacoronavírusokra vonatkozó genomi adatokból tudunk
Kínai kutatók gyorsan szekvenálták a SARS-CoV-2 genomot. Ez egy körülbelül 30 000 bázisú RNS-molekula, amely 15 gént tartalmaz, beleértve az S-gént, amely a vírusburok felszínén elhelyezkedő fehérjét kódolja (összehasonlításképpen genomunk DNS-dupla spirál alakú, körülbelül 3 milliárd bázis méretű és csaknem 30.000 gént tartalmaz).
Összehasonlító genomikai elemzések azt mutatták, hogy a SARS-CoV-2 a betacoronavírusok csoportjába tartozik, és hogy nagyon közel áll a SARS-CoV-hoz, amely felelős az akut tüdőgyulladás járványáért, amely 2002 novemberében jelent meg Guangdong kínai tartományában, majd átterjedt 29 ország, nevezetesen Franciaország 2003-ban.
Összesen 8098 esetet jegyeztek fel, köztük 774 halálesetet. Tudjuk, hogy a Rhinolophus nemzetség deneverei (potenciálisan több barlangfaj) voltak ennek a vírusnak a tározói, és hogy egy kis húsevő, a tenyér cibta (Paguma larvata) közbenső gazdaszervezetként szolgálhatott a denevérek és denevérek között.
Azóta számos betacoronavírust fedeztek fel, főleg denevérekben, de emberekben is. Így a kínai Yunan tartományban gyűjtött Rhinolophus affinis faj denevérjéből izolált RaTG13 vírust a közelmúltban a SARS-CoV-2-hez nagyon közel állónak nevezték, genomjuk szekvenciái 96% -ban azonosak. Ezek az eredmények azt mutatják, hogy a denevérek és különösen a Rhinolophus nemzetség fajai alkotják a SARS-CoV és a SARS-CoV-2 vírusok tározóját.