Az emberi és kémiai DNS hasonlóságának megjelenítése; EWSTranslate
Kaliforniai Egyetem - Riverside
Riverside, CA 92521
A teljes csimpánz genom nemrégiben megjelent publikációja, amelyet a Nature folyóirat jelent meg, azt mondja nekünk, hogy az emberek és a csimpánzok 96% -ban azonos genetikai anyaggal rendelkeznek. Ezt a számot nehéz megérteni, ami azt jelenti, hogy DNS-ünk 96% -át megosztjuk legközelebbi élő unokatestvéreinkkel.?
A közvetlen DNS-kutatás nem hasznos. Vegyük például a mitokondriális DNS mező első 100 bázispárját:
gtttatgtagcttaccccctcaaagcaatacactgaaaatgtttcgacggggtttacatcaccccataaacaaacaggtttggtcctagcctttctattag…
és az emberi mitokondriális DNS első 100 alappárja:
gatcacaggtctatcaccctattaaccactcacgggagctctccatgcatttggtattttcgtctgggggtgtgcacgcgatagcattgcgaggg
A hasonlóságot nagyon nehéz felmérni, és az emberek és a csimpánzok teljes genomja valójában körülbelül 3 milliárd hosszú bázispár.!
Építettünk egy egyszerű eszközt, amely lehetővé teszi az emberek számára, hogy vizualizálják és megértsék a DNS-szekvenciák hasonlóságát/különbségét. Míg ez a cikk jelenleg nincs publikálva és még folyamatban van, az emberi és a csimpánz DNS-ről videofelvételt tettünk közzé, amely egybeesik a teljes csimpánz genom publikálásával.
A videó körülbelül 2 percig tart, és teljesen autonóm. Az alábbiakban a Youtube változata látható, hogy inkább a nagyobb felbontású önálló verziókat szeretné látni.
- Itt van a Google Video .
- Játssza le a Quicktime verziót a böngészőben: Figyelem, a legjobb minőségű, de nagy fájl. A videók lejátszása eltarthat néhány percig.
- Játssza le az AVI verziót a böngészőben.
- Játssza le az MP4 verziót a böngészőben.
- Kattintson a jobb gombbal a Quicktime verzió letöltéséhez: Figyelem, nagy fájl (ingyenes lejátszó).
- Kattintson jobb gombbal az AVI verzió letöltéséhez
- Kattintson jobb gombbal az MP4 verzió letöltéséhez
A résztvevők rövid életrajza:
- Dr. Eamonn Keogh az UCR informatikai adjunktusa. Kutatási területe az adatbányászat és a vizualizáció.
- Dr. Stefano Lonardi az UCR informatikai adjunktusa. Kutatási területe a számítási molekuláris biológia.
- Dr. Victor B. Zordan az UCR informatikai adjunktusa. Kutatási területe a számítógépes grafika.
- Dr. Sang-Hee Lee az UCR antropológiai adjunktusa. Kutatási területe az emberi evolúció és a taxonómia.
- Manel Jara a barcelonai Autonóm Egyetem hallgatója, 2005-ben pedig az UCR hallgatója volt.
Ha meg szeretné említeni ezt a cikket, kérjük, használja:
E. Keogh, S. Lonardi, VB Zordan, SH Lee és M. Jara (2005). Az emberi és kémiai DNS hasonlóságának megjelenítése. (Multimédia videó). http://www.cs.ucr.edu/
Köszönet Colin Crenshaw-nak, Bill Yuan-chi Chiu-nak és Anwar Adinek a segítségért és a javaslatokért. A videó zenéje Chopin - 4. f-moll ballada, Op.52, Andante con moto, előadta Dr. Sang-Hee Lee .