Terminátor (genetika) - biológia

Mikor Végrehajtó vagy Átírási terminátor egy olyan genetikai szekvencia része a DNS-en, amely egy gén vagy operon végét jelöli. Az átírás megszűnéséhez vezet.

A transzkripciós terminátorok két osztálya ismert a prokariótákban:

  • Belső transzkripciós terminátorok
  • Rho-függő transzkripciós terminátorok

A terminátor általában egy rövid (4-10) GC bázispár szekvenciából áll, és az RNS-en belül helyezkedik el szinte azonnal a stop kodon után, amely leírja az ORF végét. Azokat a fehérjéket, amelyek blokkolják a transzkripció végét, antiterminátoroknak nevezzük.

Rho-független felmondás

Az ilyen típusú terminációval egy hajtű alakú másodlagos szerkezet alakul ki az RNS-transzkriptumban. Az ok a bázisok speciális sorrendjében rejlik.

A belső terminátor optimális felépítése [1] a következőket eredményezi:

biológia

  • Törzsképző GC gazdag régió 1 (6-8 bázispár)
  • Hurokképző régió (3-5 bázispár)
  • Törzsképző GC gazdag régió 2 (6-8 bázispár)
  • Poliuracil régió (3-8 bázispár)

A két GC-ben gazdag régió összefogva alkotja az úgynevezett törzset. A köztük lévő régió az úgynevezett hurok vagy hurok. Ez a hajtűszerkezet hosszú megnyújtási szünetet eredményez. Ez egyenes arányban áll a hajtű szerkezet stabilitásával. A következő 3-8 uracilcsoport destabilizálja a megnyúlási komplexet [2]. A népszerű elmélet szerint a hajtűszerkezet lerövidíti az RNS/DNS hibridet, az instabil AU párosítás pedig tovább destabilizálja a komplexet. Ennek következménye az átirat elvetése [3] .

A hajtűszerkezet fontossága a felmondáshoz

A hajtűszerkezet kétféle módon járul hozzá a végződéshez [4] [5]

  • Az RNS hajtűszerkezet a nukleotid addíció alloszterikus gátlásához vezet az aktív helyen. Ez leállítja az RNAP-t.
  • A hajtű szerkezete biztosítja az RNS - DNS hibrid elválasztását az 5'– végén.

Rho-függő felmondás

A belső terminátorokkal ellentétben az rho-függő termináció nem tartalmaz destabilizáló DNS-szekvencia elemeket. Itt a megszüntetést az Rho terminációs faktor katalizálja. A megnyúlási komplexet destabilizálja a Rho faktor helikáz aktivitása [6]. Rho a transzkriptum C-gazdag szakaszait itt hexamerként ismeri fel. Az újonnan szintetizált RNS transzkriptumon a megnyúlási komplexumtól mintegy 100 bp-os területhez kötődik. Rho ATPáz aktivitása miatt az RNS 3'-vége felé halad. A terminációs faktor ezen helikáz aktivitása az RNS/DNS hibrid elválasztásához vezet. Ennek következménye a megnyúlási komplex disszociációja és az RNS-transzkriptum felszabadulása [7] .

Megkülönböztetés

A DNS terminátor szekvenciáit meg kell különböztetni az mRNS terminátor kodonjaitól, amelyek a transzláció leállításához vezetnek.