STS-88 űrrepülési jelentés
Felszállás a Canaveral-foktól (KSC) és leszállás a Cape Canaveral-on (KSC), a 15. kifutópályán.

Az eredeti tervek szerint az STS-88-nak 1997. december 4-én kellene felszállnia a Canaveral-fokról. A Nemzetközi Űrállomás (ISS) (ISS-01-2A) első építési repülése az orosz Zarya modul indításától függött. Technikai és pénzügyi okokból ismételt késések voltak az orosz oldalon. 1998. április végén nyilvánvalóvá vált, hogy az STS-88 elindítására csak 1998. szeptember 3-án kerülhet sor. Miután az orosz fél 1998. november 20-án meghatározta Zarya kezdetét, a NASA 1988. december 3-át tűzte ki az STS-88 indulási dátumaként. Valójában Oroszország 1998. november 20-án egy Proton rakétával sikeresen elindította az első Zarya űrállomás-modult a tervezett földpályára. Semmi sem akadályozta az STS-88 missziót. Kisebb technikai problémáktól eltekintve a visszaszámlálás zökkenőmentesen zajlott. Az ütemezett kezdési napon technikai probléma merült fel, amikor a "kiegészítő tápegységek" (APU) elindultak. Annak ellenére, hogy ez érzékelőhibának bizonyult, a szükséges ellenőrzések miatt az indítási ablak a napra ismét bezárt. Az indulást tehát 24 órával el kellett halasztani.
A fő missziós feladatok az Unity modul szállítása volt, az űrállomás első csatlakozási modulja, két összekapcsoló adapterrel (PMA-1 és PMA-2) együtt. Az alkatrészeket a pályán kell elhelyezni az "Orbiter dokkoló rendszeren" (ODS), majd össze kell kapcsolni Sarjával. Ezt követően a modulokon három űrhajó-küldetés során felszerelési munkát kellett végrehajtani.
A földi pályára jutás után a legénység kinyitotta az Endeavour rakterének ajtaját, tesztelték az RMS megfogókar különféle funkcióit, kibontották a találkozáshoz szükséges Ku-sávos antennát és elkezdték igazítani a repülési útvonalat a Zarya modulhoz. A repülés második napján Jerry Ross előkészítő munkájára és James Newman külső manőverére összpontosítottak. A kabin nyomását szintén csökkentették erre a célra. Tesztelték az "Orbiter Space Vision System" -et (OSVS) is, amely állítólag pontos helyzetadatokat szolgáltat a randevú manőver során.
A repülés harmadik napján Nancy Currie kezdetben függőlegesen emelte az Endeavour Unity-t a megfogókarral, 90 fokkal elforgatta a modult, és az Unity-t az "Orbiter Docking System" -re (ODS) helyezte. Az ODS kapcsolási mechanizmus az APDS volt az aktív rész, míg a PMA-2é a passzív rész. A manőver hasonló volt az STS-74-hez, a Mir űrállomás "dokkoló moduljával". Az Unity azonban lényegesen nagyobb volt, mivel néhány centiméterre kitöltötte az Endeavor rakterének átmérőjét. Amikor a keringő és az Unity közötti távolság csak néhány centiméter volt, Robert Cabana kilőtte az űrsikló vezérlő fúvókáit, és az űrhajót az új ISS modulba tolta. Miután megállapította a nyomáskiegyenlítést az ODS és a PMA-2 között, Jerry Ross és Robert Cabana képesek voltak megnyitni a csatlakozó nyílást és először lebegni a PMA-ban.
Ennek a repülési napnak a vége felé az Endeavour-nak további pálya-manővert kellett végrehajtania annak érdekében, hogy biztonságos távolságot érjen el a kiégett Delta II rakétaszakadtól.
Az új űrállomás „születését” a repülés negyedik napjára, 1998. december 6-ra tervezték. Eleinte a törekvés mintegy 300 méteren belül megközelítette Zaryát. Az orosz modult időközben a repülésirányítók vitték dokkoló helyzetbe, így annak felső oldala a repülés irányába, a hátsó tengely csatlakozóaljzata pedig a föld felé mutatott. Ezután az Endeavour a modul felé repült az úgynevezett "R-Bar Approach" mentén, vagyis a sugár vektor mentén. 180 méteren Robert Cabana közvetlenül Zarya alatt ért el egy pozíciót. Kézi vezérléssel enyhe spirálban repítette a keringőt Zarya felé. A PMA-1 mindig az orosz modult mutatta. A manőver végén Zarya majdnem az űrhajó hasznos teherterének szélén állt.
Nancy Currie ezután megragadta a Sarja modult a foglalatánál az RMS segítségével, és lassan manőverezte az űrállomás vezérlőmodulját az űrrepülőgép felé az Unity modullal, amíg mindkét elem csak 10 centiméterre volt egymástól. Most hasonló repülési manőver következett, mint előző nap, amikor a Unity-t felvették az ODS-be. Robert Cabana aktiválta az Endeavour vezérlő fúvókáit, és óvatosan Sarja felé vezette a keringőt, amíg mindkét modul össze nem kapcsolódott. Az első két elemet összekötve képezték az ISS űrállomást, és 22 méterre álltak ki a hasznos teherhordótól.
1998. december 7-én Jerry Ross és James Newman teljesítette az első EVA-t ezen a küldetésen (7 óra 21 perc). Annak érdekében, hogy a két ISS-modult előző nap mechanikusan összekapcsolják és működésre készen álljanak, a két űrhajósnak 40 táp- és adatkapcsolatot kellett lefektetnie. James Newman átadta a kábeleket és a dugókat az eszköztárból, Jerry Ross pedig összeszerelte az alkatrészeket. Az Unity-t 34 kábellel csatlakoztatták a két PMA-hoz, míg a fennmaradó hat kábel biztosította az áramellátást Zarya-tól a Unity-ig. Jerry Ross és James Newman fedeleket is rögzítettek a csatlakozókhoz, és eltávolították a hőgátat a külső számítógépen a Unity-nél. Mivel az EVA űrhajósok jóval előrébb jártak, mint a menetrendjük, még mindig olyan feladatokat hajtottak végre, amelyeket csak a következő űrhajó-küldetésre terveztek. Ez magában foglalta hat fogantyú csavarozását a Unity modulra, aminek megkönnyítenie kell a jövőbeni EVA-k mozgását. Megvizsgálták a Zarya modul két nem meghosszabbított antennájának egyikét is. A munka során Jerry Ross elvesztette a zsinórtáskáját és még egy tárgyat. Mindkettő néhány hónappal később felégett a föld légkörében.
A repülés hatodik napja elsősorban a legénység pihenését hivatott szolgálni. Csak Robert Cabana és Frederick Sturckow emelte meg a keringő és az űrállomás pályáját az Endeavour motorok segítségével. Ennek hosszabb élettartamot kell elérnie az ISS számára.
Jerry Ross és James Newman második űrhajó-küldetése 1998. december 9-én (7h 02m) az antennaépítésről szólt. Első lépésként két, 45 kilogramm súlyú adóantennát csatoltak a Unity modul mindkét nyílásához. Ennek célja a folyamatos adatátvitel az S-sávon át a NASA földi állomására az ISS korai szakaszában. Az STS-92 rendszert ki kell cserélni egy erősebb Ku-band rendszerre. Külső videokábel telepítésével a Mission Control képes volt közvetlenül figyelemmel kísérni a Unity funkcióit, és lehetővé tette a videokonferenciákat. Az EVA további feladatai közé tartozott a szigetelés felhelyezése a Unity külső bőrére és egy napvédő pajzs felszerelése a külső számítógépekre. Jerry Ross elvesztette az egyik hővédő burkolatot. Utolsó lépésként az űrhajósoknak sikerült kiszabadítaniuk a TORU randevúrendszer két elakadt antennájának egyikét Zaryából. Ehhez James Newman, miközben a robotkaron állt, három méter hosszú rúddal többször megütötte az antennát.
1998. december 10-én az ISS űrállomást Robert Cabana és Sergej Krikaljow állította üzembe. A két modulon belül eltávolították a szállítókonzolokat, eltávolították a szerszámokat és a felépítményeket, amelyeket külsõen kellett rögzíteni, és a polcokat megtöltötték az elsõ rendszeres személyzet számára szánt anyagokkal. Ezenkívül rajongókat állítottak fel, hordozható számítógépeket hoztak az Endeavourtól az űrállomásra és válogatták az alkatrészeket. Ezután Robert Cabana és Sergej Krikaljow kinyitották az átmeneti nyílást a Zarya modulhoz. Itt Nancy Currie és Sergej Krikaljow kicserélték az akkumulátor rendszer hibás részét és egy szűrőt. Jerry Ross és James Newman ellenőrizte a videokonferencia rendszert. Jó 28 órás tartózkodás után a két állomásmodul nyílása ismét bezárult.
1998. december 13-án az Endeavour legénysége lekapcsolódott az ISS-ről. Az űrsikló eltávolodott tőle 137 méteres távolságra. Innen Frederick Sturckow másfélszer repült az új pályaállomás körül, mire az Endeavor motorjai újraélesztettek, és az űrsikló megnövelte a távolságot. A most lakatlan ISS-t a küldetésvezérlés automatikus üzemmódba kapcsolta.
A repülés további folyamán a kis argentin SAC-A teszt műholdat (Satelite de Aplicaciones/Cientifico) indították az űrbe. A MightySat, az amerikai légierő katonai kísérleti műholdját is pályára állították. A 320 kilogrammos Trabantot az űrutazás új technológiáinak kutatására is használták.
Ezenkívül számos kisebb tudományos vizsgálati létesítmény is helyet kapott az Endeavor hasznos teherterében. Az "alkálifém hő-elektromos átalakítóval" (AMTEC) megpróbálták hatékonyabban átalakítani a hőenergiát elektromos energiává. Az "Automated Wafer Cartridge System" (AWCS) segítségével a félvezető lemezek mozgási szekvenciáit egy speciális tárolási területen tovább kell adni egy szimulált gyártási mezőnek. A cél egy nagy tisztaságú félvezető lemezek automatizált gyártási folyamatának tesztelése volt. A hallgatói kísérletek az "űrkísérleti modulban" (SEM) repültek.
A fék ejtőernyőt nem használták leszálláskor, miután a tengely fedőlapja leesett, amikor az STS-95 felszállt. Mivel a technikusok addig nem tudták teljesen tisztázni ennek okát, a pirotechnikai motort eltávolították az esernyő beindításához, és a fedél helyett egy speciális panelt helyeztek el.