5 sapkás szerkezet
A Sapka szerkezete az 5'-vég módosítása, amely megtalálható az összes eukarióta mRNS-ben és sok nem kódoló RNS-ben. Ez általában egy módosított guanin-nukleotid, amely egy ritka 5'-5'-foszfodi-észter kötéssel kapcsolódik az RNS fejéhez a gén átírása során (az egyik Capping).
További ajánlott szakismeretek
Tartósan pontos tesztsúly a 12 ingyenes tippnek köszönhetően
Magasabb mérési teljesítmény 6 egyszerű lépésben
A pipetták gyors ellenőrzése?
Ezek Sapkák-A szerkezet drámai módon növeli az RNS stabilitását, és fontos az RNS sejtmagból a citoplazmába történő transzportjához és az mRNS-ek ezt követő riboszómák általi transzlációjához. A splicinghez és a poliadenilezéshez (faragáshoz) hasonlóan a lezárás ko-transzkripcionálisan történik, vagyis amíg az RNS polimeráz még mindig szintetizálja az RNS-t. Az egyik tehát egy RNS-gyárról beszél (lásd: illesztés).
Milyen sapkaszerkezetek vannak?
Az RNS polimeráz II által átírt messenger RNS-ekkel megtalálható a klasszikus m 7 G sapka. Itt (a terminális gamma-foszfát trifoszfatáz általi hidrolízise után) az úgynevezett záró enzim egy GMP-maradékot (GTP-ből) 5'-5'-foszfodiészter kötés formájában visz át az RNS 5'-végére, majd A guanin 7. helyzete S-adenozil-metionin (SAM/Adomet, univerzális metilcsoport donor) fogyasztásával metilezett, az eredmény: 5'-5 ' m 7 GpppN. Ezen túlmenően az mRNS első bázisainak további metilezései következnek be, azután Cap1-ről, Cap2-ről stb. Beszélünk.
Egyes vírusok sajátosságot mutatnak a kupak szerkezetének bioszintetikus útvonalában: a GTP-t először metilezik, és csak azután helyezik át az RNS-be.
Egyes snRNS-ekben, amelyek fontos funkciókat látnak el a splicingben, a m3 G-cap, a m 7 G-cap, amelyben két további metilcsoportot vittek át a bázis 2. pozíciójába a citoplazmában történő érlelés során ( m2,2,7 trimetil-guanozin sapka).
Az RNS-polimeráz III transzkriptumok nem tartalmaznak ilyen 5'-cap struktúrákat, de néhány RNS-nek monometilezése van egy γ-foszfát maradékon (pl. U6 snRNS).
Továbbá a trippanoszómákban például sokkal bonyolultabb sapkaszerkezetek találhatók, amelyekben nemcsak az első nukleotid módosul, hanem az azt követő nukleotidok is (pl. Trypanosoma brucei Cap-4).
funkció
Az mRNS-ek 3'-végén lévő poli-A farokhoz hasonlóan a sapkaszerkezet is fontos szerepet játszik az mRNS-ek stabilizálásában. E szerkezet nélkül az exonukleázok a citoplazmában lévő mRNS-eket gyorsan 5 ’-ről 3’ -ra bontják.
A kupak fontos szerepet játszik abban is, hogy az RNS a sejtmagból a sejtmag pórusain keresztül a citoplazmába áramlik (RNS export). A transzkripció során a kupakkötő komplex (CBC20 és CBC80) köti, amely más tényezőkkel együtt biztosítja a hatékony transzportot.
A felső határ kulcsfontosságú a fordítás megkezdése szempontjából is. Mind a CBC (az első fordítási forduló során), mind az eIF4E (minden további forduló alatt) megkötve biztosítja a riboszóma felvételét és az inicializálással kezdődik. Ez az RNS gyűrűzáródásához vezet (a transzláció zárt hurok modellje), amelyben az 5'-vég kölcsönhatásba lép a poli-A farokkal (eIF4E, eIF4G és a citoplazmatikus poli-A kötő fehérje PABPC útján).
Mivel egyes vírusok kizárólag a citoplazmában replikálódnak, nem kapnak kupakszerkezetet a sejtmechanizmusból. Az ezzel járó hátrányok ellensúlyozása érdekében "ellopnak" egy sapkát a sejtes mRNS-ekből, ezt kupak kiragadásnak nevezik. A gazdaszervezet mRNS-ét az 5'-vég közelében (amely a sapkát viseli) hasítják fel, és úgynevezett "fedett vezetőként" használják a vírustranszláció megindításához.