Bevezetés a természetes populációk genetikájába - 1
Bevezetés a természetes populációk genetikájába
1. Elméleti és statisztikai fogalmak
Teljes szöveg
- 1 Az RNS vírusok kivételével, amelyek szigorúan véve nem valódi élőlények, bár (.)
1. ábra. Vázlatos példa három kromoszómával rendelkező fajban, ahol öt genetikai markert (vagy lókuszt) határoztak meg. Megjegyezzük, hogy ebben a példában csak két lókusz heterozigóta (két különböző allél, amelyet különböző intenzitású színek jelképeznek), és hogy a többi homozigóta (kétszer ugyanaz az allél)
2 A különféle elérhető markerek érdemeit és különbségeit széles körben tanulmányozták, és számos többé-kevésbé kimerítő áttekintés tárgyát képezte, amelyek további részletekért olvashatók (R oderick, 1996; S unnucks, 2000; C aterino et al., 2000). Ezért csak ennek a témának a felületét fogom megkarcolni, amelyet úgy döntöttem, hogy három egyenlőtlen részre osztom (citoplazmatikus markerek, domináns nukleáris markerek és kodomináns nukleáris markerek). Ezért csak eukarióta organizmusokról fogunk beszélni.
30%) izoenzimatikus markert használtak. A vizsgálatok további részében mikroszatellit markereket használtak, amelyek ár/minőség szempontjából véleményem szerint közvetlenül az izoenzimek után jönnek. Ennek eredményeként általában ez a két típusú markerek használják a populációgenetika vizsgálatában (főleg a mikroszatellitek most, mert az allozimek ma már meglehetősen elavultak), és főleg azok, amelyeket a legjobban ismerek. Valószínűleg ez az utolsó ok felel meg választásomnak, amely mindenesetre nem tiltó, mivel az ebben a kézikönyvben megadott információk szinte mindegyike alkalmazható az összes kodomináns markernek. Más technikák áttekintése érdekében csak arra ösztönözhetem az olvasót, hogy tanulmányozza a meglévő áttekintéseket (T aylor et al., 1999; C aterino et al., 2000; S unnucks, 2000; B ougnoux et al., 2004).
Allozimek
Nincs folt, ha nem értelmezhető csíkok vannak a gélen
7 Fókuszálnia kell, vagy másik helyre kell költöznie.
Az összes egyén által feltárt foltok ugyanazon a szinten találhatók
8 Ez történik, mint a 2. ábrán, amikor a technika nem teszi lehetõvé több allél megkülönböztetését a megfelelõ lokuszban, akár azt, hogy ez utóbbi maga nem változó, akár azt, hogy a meglévõ variációk nem generálnak alléleket kellõképpen. a technika által érzékelhető különböző elektromos töltések.
2. ábra: Egy monomorf enzim ábrázolása
9 Az enzimről azt mondják, hogy monomorf, vagyis legalábbis tipizált egyének esetében (mondjuk genotipizálva) nincs polimorfizmus, ezért az enzimet kódoló lókusz nem használható (információ nem áll rendelkezésre). Minden ember egy azonos töltésű enzimet termel. Becslések szerint az enzim génjének megfelelő DNS-mutációknak csak egyharmada ad olyan különbséget a töltésben, hogy az elektroforézissel is látható legyen (S haw, 1970).