Pmeasyr project exkluzív interjú A PMSI blogja
Szeretnénk kiemelni a pmeasyr projektet, egy R betűs csomagot, a statisztikáknak szentelt nyelvet, amely jól ismert a DIM számára, amely lehetővé teszi a PMSI elemzések független elvégzését, beleértve a nagy, több mint 100 000 soros PMSI adatbázisokat. Ez egy AP-HP-n született nyílt forráskódú projekt, amely a PMSI összes területét (MCO, SSR, PSY, HAD és ACE) kezeli. Fedezze fel a pmeasyr videót
Néhány lehetséges eredmény a pmeasyr használatával:
# Az MCO kóddal vagy diagnosztikai kódcsaláddal marad, függetlenül a DP, DR vagy DAS pozíciótól (pl .: epilepsziás kóddal marad)
# Az MCO az EBLA003 "mélyvénához kapcsolt katéter elhelyezése" mellett marad, függetlenül az aktust kódoló RUM-tól
# az E66-os elhízási kóddal rendelkező betegek aktív sora a létesítményben és/vagy az elhízási kód kódolási helye szerint
# a műtét aktív aktája, megkülönböztetve a CCAM tevékenységeket
# DMS 0 napnál hosszabb tartózkodások esetén
# DMS: GHM/GHS
Hogy többet megtudjon, a projekt kezdeményezésére megkérdeztük Guillaume PRESSIAT-ot, aki szívesen válaszolt kérdéseinkre.
Helló PRESSIAT úr. Néhány szó a pmeasyr projekt bemutatásához. Meg tudná mondani, hogyan jött létre ez a projekt az AP-HP DIM-en belül? Annak kielégítésére, amire a PMSI elemzésnek szüksége van, a jelenlegi PMSI elemző és statisztikai szoftver nem felel meg ?
Helló, az első ötlet az volt, hogy olyan szoftverekre összpontosítsak, amelyeket szívesen használok. Ez nem azt jelenti, hogy el kell hagyni más szoftvereket, de az R koncentrálni tudja a vizsgálat legtöbb szakaszát: importálja az adatokat, elvégzi az elemzéseket, és elkészíti az eredményeket bemutató dokumentumot a kommunikációjukhoz. Túl gyakran zsonglőrködünk több szoftver között, ami hibákat és zavart okoz.
A projekt ezért abból a szükségből fakadt, hogy megosztom Dim orvosokkal, közegészségügyi gyakornokkal és statisztikusokkal, hogy bizonyos felhasználási szabadsággal, tartózkodási szinten hozzáférhessek az adatokhoz, lehetőség szerint a piacon lévő szoftverek nélkül. A projekt történetét itt nem részletezem: lényegében 2016-ban az R felhasználók csoportjának létrehozása a Dim AP-HP között megnyitotta a csomagot a többi felhasználó előtt, és lehetővé tette a csomag használatának formalizálását. Az AP-HP-n kívüli sugárzást a githubon keresztül valósították meg, a következő ötlettel: akiknek szüksége van egy ilyen megoldásra, használhatják és javíthatják a részvételükkel, ha akarják.
A lehetséges lekérdezések meglehetősen korlátlanok (felhasználói ötletek és adatok korlátozzák). Hogy a helyszínen bemutatottaktól eltérõ példát említsek, meglehetõsen egyszerû és gyors intra/mezõközi láncolást végezni, és így leírni a beteg útjait. Könnyen készíthetünk interaktív térképeket és vizualizációkat is R-ben.
Melyik csapat dolgozik jelenleg az AP-HP pmeasyr fejlesztésén ?
Én vagyok a pmeasyr fejlesztője, és vannak statisztikusok és Dim orvosok, akik használják a csomagot, hozzák el nekem ötleteiket, megjegyzéseiket és megjegyzéseiket.
Szeretnék köszönetet mondani az R-felhasználók csoportjának az AP-HP-nél. Különösen Dr. Namik Taright (DIM központ - DOMU - AP-HP) útmutatásaiért és ötleteiért, Dr. Kristel Cosker (HU Pitié Salpêtrière) a csomag használatáért, elérhetőségéért és minden megjegyzéséért, valamint Dr. Rémi Flicoteaux (HU Saint Louis Lariboisière) motivációja és az általa kínált munka lehetőségei.
A különböző AP-HP létesítményekből származó IMG-k működnek a pmeasyrrel? Milyen a hozamuk ?
Néhány AP-HP dimmer valóban használja a csomagot, visszajelzéseik alapján javíthatom a dokumentációt és magát a csomagot. A pozitív visszajelzések pontosan a jó kezdetet lehetővé tevő dokumentációt érintik; Újabb visszajelzést kaptam a csomag egyszerű használatáról. Negatívabb visszajelzés a csomag által lefedett évekre vonatkozik (a kezdő év 2011), míg egyes klinikai vizsgálatok (kohorszok) esetében régebbi adatokra van szükség: ebben az esetben a pmeasyr nem megfelelő. Ezt a kiindulópontot 2011-ben azzal magyarázom, hogy ettől az évtől a formátumok homogénebbé váltak.
Van kapcsolata más kórházakkal? Dolgozik-e már közülük valaki vagy szándékozik-e dolgozni pmeasyr-en? ?
Volt több kapcsolattartóm Franciaország-szerte. Ezt az érdekes dimenziót egy eszköz megnyitásában fedeztem fel: kapcsolatba lépni velünk ugyanazt a munkát végző emberekkel, de a létesítmények különböző kategóriáiban. Kérdéseik a pmeasyr telepítéséhez, az adatformátumhoz kapcsolódnak, vagy az ATIH eszközök és lamda adások velejárói, és néha általában az R-re vonatkoznak. Visszajelzésük a csomagról meglehetősen pozitív.
A csomag kinyitása során gondoltunk annak használatára a GHT-k megvalósításának összefüggésében: a PMSI-adatok összesítése (azonos formátumban vannak), aktivitás, aktív várólista, a GHT-n belüli betegutak tanulmányozása ...