TD Biokémia n; 4. elektrofor; se, 1. exp

1. kísérlet: Genida DNS bank felépítése Candida albicans számára.

A kísérlet célja:

Egy (egy marker) inszerciós mutációs könyvtár létrehozásához először fel kell építenie egy genomi DNS-könyvtárat. Az inszertációs könyvtár segítségével felkutatjuk a Candida albicans biofilm képződésében részt vevő géneket. Ezzel az opportunista gombával gyakran találkoznak immunszuppresszált betegeknél (pl. AIDS), ahol behatol a nyálkahártyákba, és kandidózist okoz (fotó). Ugyanakkor a felületek kolonizációja (és egy biofilm képződése), például az érkatétereké, szintén fontos probléma az orvostudományban (kórházi fertőzések), mivel "disszeminált" kandidózist okozhat (ami súlyos elváltozásokat okozhat potenciálisan minden belső szerv).

Előszó: Utasítás:

Szüksége van felülvizsgálatra? Itt van: Bevezetés
25 perc áll rendelkezésére a kísérlet végrehajtására. Ne pazaroljon túl sok időt.
Gondosan olvassa el az élmény leírását. Amikor felkérnek egy választásra, gondold át, és kattints a számodra legértelmesebb válaszra.
Még akkor is, ha helyesen válaszolt, ne felejtse el elolvasni a többi választást.
A válaszok a dőlt betűvel általában egy másik html oldalon jelennek meg (kattintson a kérdésre). Ne maradjon le ezeken a kérdéseken.
A pirossal ellátott kérdéseket a tapasztalatok szintézise során vitatják meg.
Ha nem hajtja végre a kísérletet a megadott időn belül, később újra megteheti. Az élmény webcíme a Dokeos-on található.
Bármikor elküldheti nekem észrevételeit e-mailben: [email protected].

Ezt a virtuális élményt valós tapasztalatok ihlették, azonban az oktatóanyag érdekesebbé tétele és a kérdések ösztönzése érdekében adaptációk történtek (amelyek közül néhány nem valószínű).

Bevezetés:

Egyezmény: 1Mb = 1'000 kb = 1'000'000 bp. Ez a módszer a páros nukleotidokban lévő DNS-molekulák méretének számszerűsítésére. Minden aminosavat (aa) 3 nukleotid (= kodon) csoport kódol (DNS/RNS-en). ORF (= nyitott leolvasási keret; a fehérjét kódoló gén egy része) mérés

1kb ezért kódolja a fehérjét

A Candida albicans egy diploid, egysejtű (alsó eukarióta) gomba, amely egyetlen sejtként és hifaként (az összekapcsolt sejtek szálai) növekszik. A C. albicans által alkotott biofilm egysejtű, pszeudohifális vagy akár hifális sejtekből és egy extracelluláris mátrixból áll, amely poliszacharidokból és fehérjékből áll. Ez a biofilm megvédi a C. albicans-t különösen a gombaellenes szerektől. A biofilm képződése három szakaszban zajlik: először egysejtű telepek alakulnak ki; akkor a sejtek pszeudohifális konformációt vesznek fel, és extracelluláris mátrixot hoznak létre. Végül a mátrix és a filamentumok (hipha) együtt nőnek.