Az elhízás spermiumai - A genomika gyógyszertudományának krónikái
Bertrand Jordan 1, 2 *
1 UMR 7268 ADÉS, Aix-Marseille, Egyetem/EFS/CNRS, Mediterrán Etikai Tér, La Timone felnőtt kórház, 264, rue Saint-Pierre, 13385 Marseille Cedex 05, Franciaország
2 CoReBio PACA, box 901, Luminy tudományos park, 13288 Marseille Cedex 09, Franciaország
Az elhízott egyének (némileg) specifikus differenciális RNS-tartalmának és DNS-metilációjának bemutatása megnyitja az epigenetikus átvitel lehetőségét az utódok számára.
(→) Lásd a DOHaD tematikus kiadást, Kisasszony 1. szám, 2016. január
(→) Lásd még a DOHaD tematikus kérdést, Kisasszony 1. szám, 2016. január
A sovány és a kövér: egészen finom különbségek
A szerzők 13 normál túlsúlyos (átlag BMI 22,9) 1 és 10 elhízott (átlag BMI 31,8) spermiumát elemezték a hiszton pozicionálás szempontjából (a sejtek nukleáz emésztésével). Micrococcus 2), kis, nem kódoló RNS-tartalom (kicsi, nem kódoló RNS-ek, sncRNS-ek) és metilezés (biszulfit-kezelés utáni szekvenálással). Nem figyeltünk meg különbséget a két csoport között a hisztonok helyzetében. Az sncRNS szintjén a legjellemzőbb fajok a transzfer RNS fragmensek, valamint a Piwi fehérjékkel kölcsönhatásban lévő RNS-ek (piRNS-ek), amelyek részt vesznek a génexpresszió szabályozásában [8]. Jelentős különbségek figyelhetők meg az expresszióban körülbelül 40 piRNS esetében, amelyek közül néhány szabályozhatja az étvágyban részt vevő géneket. A megállapított különbségek ennek ellenére szerények, a két csoportban megfigyelt értékek részleges vagy néha teljes átfedésével járnak. (1.ábra).
A piRNS differenciális expressziója "sovány" és "zsíros". Az y tengelyen az expresszió szintje a mintában lévő összes piRNS-re normalizálódott; kék: vékony alanyok, piros: kövér alanyok. Ezek vitathatatlanul a legélesebb különbségek, de láthatjuk, hogy nagyrészt átfedik egymást. A fekete pontok megegyeznek a szerzők által kiemelkedőnek ítélt értékekkel (Donkin kivonata a 2. ábrából) et al. [6]).
A metilezési adatok azt mutatják, hogy sok, több mint 9000 gén differenciáltan metilálódik, néha jelentős különbségek vannak a két csoport spermájának között. E gének természetének elemzése (annotáció: Gén ontológia) szerény gazdagodást mutat azok számára, akik részt vesznek a központi idegrendszer fejlődésében és működésében (2. ábra). A szerzők kapcsolatot teremtenek az elhízott apák gyermekeinél az autizmus fokozott kockázatát jelző munkával [9] - tekintettel a megfigyelt gazdagodás szerénységére (2. ábra), meglehetősen szkeptikus maradhat. Végül az elhízásban ismert DNS-variánsok elemzése kizárja, hogy ezek felelősek a megfigyelt különbségekért (más szóval, hogy genetikai jelenségről van szó, és nem epigenetikáról).
A gének funkcionális szempontból jegyzeteltek (Gén ontológia) adatbázisokban. Rózsaszínben: differenciálisan metilezett gének; kék színnel: annotált gének halmaza. Látható, hogy a bemutatott kategóriákba tartozó gének kissé gyakoribbak a differenciálisan metilezett gének között (Donkin 3. ábra kivonata et al. [6]).