Az elmúlt évek terhe
De Ottheinrich utolsó évei, amelyeket választóként Heidelbergben töltött, kevésbé ismertek. II. Frigyes nagybátyja 1556 február 25-én bekövetkezett halála után, két héttel később, elvállalta az örökséget. Mint a pfalzi Ruprecht fia és Őszinte Fülöp választó unokája, ezt valójában sokkal korábban megadták volna neki.

De amikor 22 éves volt, Ottheinrich hagyta, hogy nagybátyja lebeszélje a követeléséről. Már akkor súlyos beteg volt, amikor Palatinate választófejedezetté koronázták. Légszomj, csepp, reuma és elhízás (kb. Négyszáz font) súlyosan sújtotta, ami miatt újra és újra panaszkodott "pufók" testére. Ottheinrich a hátralévő három évet Heidelbergben választóként használta fel a reformáció ottani végrehajtására. 1556. április 16-án reformációs megbízást adtak ki a világi tisztviselőknek a "hamis istentisztelet" ellen. Megbízatásával kiváltotta az Első Pfalz első ikonoklasztját is, bár részben a lakosság keserű ellenállása ellen. A reformáció alapját az 1543-as neuburgi hercegségben hozott rendeletek és vallási felhatalmazás jelentette. A Heidelberg Schlossbergre építve az Ottheinrichsbau, a német reneszánsz egyik fő alkotása, megalapította a világhírű "Bibliotheka Palatina" -ot, és alapvetően megreformálta az egyetemet.
A reichi politika szempontjából sikertelen kísérletet tett arra, hogy egyesítse protestáns társait egy olyan szövetségben, amely a császárt és a katolikus birtokokat kényszeríthette az augsburgi vallási béke módosítására.
Halálát, csaknem három évvel szeretetlen nagybátyja halála után, 1559. február 12-én őszintén gyászolták Heidelbergben. A heidelbergi egyetemen tanító Francois Baudouin temetési beszéde (lásd saját cikkét) Ottheinrichet "a legjobb és legnagyobb hercegünknek" nevezi, és olyan nagy ősi személyiségekkel hasonlítja össze, mint Augustus vagy Theodosius. Érdekes, hogy a beszélőnek csak rövid ideig volt szabad, homokórával mérve.
Végül még két példa, amelyek bizonyítják, hogy Ottheinrich nemcsak a csodálatos és érzéki reneszánsz herceg volt, akit általában ábrázolnak, hanem hogy társadalmi mélységet is megmutatott. Végrendeletében, egy kézzel írt codicillumban örökségeket tárt fel a bírósági tisztviselőkre és alkalmazottakra, akik meghatározták, kinek kell továbbra is foglalkoztatnia és kik kapnak végkielégítéseket. Többek között egy szolga öröksége van kitéve, "a vill mustnak és a munkának segíteni kellett nekem a kocsiból fel és le." Arra is figyelmeztette utódait, hogy mindig tájékozódjanak jogaikról, és ne támaszkodjanak olyan rokonokra, akiktől csak "rosszallást" tudtak meg. Itt valószínűleg arra utal, hogy a heidelbergi örökség iránti igényét megfojtották tőle.
A nagy szerelem
Az 1559-ben készült rézmetszeten az elrontott Ottheinrich, amelyet már szenvedései is erősen jellemeznek, utoljára ábrázolható. Felesége, Susanna, aki 1543-ban hunyt el, a háttérben látható, ami jelzi a kettő közötti nagy szeretetet. Susanna halála után Ottheinrich nem kötött második házasságot.
A közlemény a "Von Kaisers Gnaden - 500 éves Pfalz Neuburg" című kiállítás katalóguskötetén és a "Pfalzgraf Ottheinrich - politika, művészet és tudomány a 16. században" című könyvön alapul.