Didier Raoult; Oleg Mediannikov; IHU

Az emberi mikrobiota és a gyors baktériumok tenyésztésének vizsgálata

1. csapat: UMR D-258, mikrobák, evolúció, filogenitás és fertőzés (MEPHI)
Aix-Marseille Egyetem (AMU), Fejlesztési Kutatóintézet (IRD)

didier

Csapatvezetők:
Tagok
  • BREGEON Fabienne
  • DAVOUST Bernard
  • EDOUARD Sophie
  • LAGIER Jean-Chirstophe
  • MERHEJ Vicky
  • MILLIÓ Matthew

1. Tudományos stratégia és projektek

A kultúra továbbra is nélkülözhetetlen elem a mikrobiológia és a fertőző betegségek kutatásában (5). Így a mikrobiotában a baktériumok repertoárjának növelése mellett a kulturomika különféle alkalmazásokat tett lehetővé. Egyrészt ezen új baktériumok közül néhányat kimutattak klinikai mikrobiológiai laboratóriumunkban fertőzések esetén (6). Másrészt a kulturomikával kezelt gyűjteményünk egyes törzsei hasznosak voltak a Gustave Roussy Intézet csapata által kidolgozott projektek során a mikrobiota és az immunmoduláló rákkezelések hatékonyságának kapcsolatával kapcsolatos munkájuk során (7).

  • Mikrobiota és táplálkozás

A táplálkozás az emberi mikrobiota fő meghatározója. Csapatunk először a károsodott mikrobiota és az elhízás közötti összefüggéseket vizsgálta. Első alkalommal mutattuk ki a metanogén Archaea, a Bifidobacterium, beleértve a B. animalis-t, és a Lactobacillus casei csökkenését az elhízásban (8). Ez a 2 faj (L. casei, B. animalis) különösen fontos a táplálkozásban, mert ők a 2 faj, amelyek a világon leggyakrabban probiotikumként kerülnek forgalomba. Megfordítva, azt találtuk, hogy a Lactobacillus egyik faja: a L. reuteri elhízással volt összefüggésben (8).

A súlyos akut alultápláltság mikrobiota-változásainak vizsgálata lehetővé tette számunkra az anaerob mikrobák és a metanogén archeák elvesztésének kimutatását (9). Ezt össze tudtuk kapcsolni az emésztőrendszer fizikai-kémiai viszonyainak megváltozásával, a redoxpotenciál növekedésével (az emésztőrendszer oxidációja). Lehetséges, hogy ez az oxidáció, amely valószínűleg az étrend antioxidáns-hiányával társul és felelős az oxidatív stresszért, egyes emésztési mikrobák visszafordíthatatlan veszteségét okozza a gyermek számára. Másodszor, azonosítottuk, hogy mely baktériumokat veszítette el a Microbial Culturomics, és javaslatot tettünk 13 faj probiotikus koktéljára, amelyek 5 tejsavbaktériumot (Bifidobacterium adolescentis, Lactobacillus parabuchneri, L. perolens, L. vakcinoztercus és Weisselle confusa) tartalmaznak, de a butirátot termelő anaerobokat is ( 10.) Ez a koktél csak a terápiás rend szerint refrakter súlyos akut alultápláltság eseteinek kezelésére javasolható.