Mikrobiota és IBD; FMC-HGE
oktatási célok
- Ismerje a mikrobiota összetevőit
- Ismerje az eubiosis és a dysbiosis fogalmait
- Ismerje a mikrobiota részvételét az IBD genezisében
- Ismerje a mikrobiota terápiás célú módosításának módozatait
Teszteld magad
Kulcsszavak: bél mikrobiota, krónikus gyulladásos bélbetegség
Érdekes kapcsolatok
PhM meghívó/előadó:
Abbvie, Astellas, Biocodex, Danone, Hospira-Pfizer, Janssen, MSD, Ferring Pharmaceuticals, Takeda. JD Meghívó/előadó: Biocodex, Danone, PiLeJe, Janssen, Enterome, MaaT Pharma, Indigo Therapeutics
PhS meghívó/előadó:
a Takeda, a Merck MSD, a Biocodex, a Ferring, a Takeda és az Abbvie díjai
Ismerje a mikrobiota összetevőit
A mikrobiota kifejezés az ökoszisztémában jelen lévő összes mikroorganizmus (baktériumok, archeák, élesztők, gombák, vírusok, bakteriofágok) jelölésére szolgál. Az emésztőrendszerben található fülkék között különbözik a rá kirótt ökológiai viszonyok (szelekciós nyomás) (pH, oxigénkoncentráció, epesavak, tápanyagok stb.) Miatt [1]. Az emésztőrendszer ugyanazon szintjén különbségek vannak a bél lumenje, a felszíni nyálka és a mély nyálka között is, amelyek a bélből antibakteriális szekréciót, például IgA-t vagy defenzineket koncentrálnak [1]. Itt elsősorban a széklet mikrobiotáját írjuk le, amely a legismertebb és amely, bár távolabb van az emberi sejtektől, mint a nyálka, bizonyított kapcsolatot mutat a fiziológiával, az egészséggel és a betegségekkel.
I. táblázat: A bél mikrobiotájában található fontos mikroorganizmusok és helyük a filogenitásban *
(molekuláris markerek léteznek a székletben vagy a nyálkahártya mintájában található baktériumfajok, de nemzetségek vagy phylae felismerésére is)
A baktériumok, az archeák, a gombák (mikobioma) mikrobiális asszociációi nem a véletlen eredmények, hanem éppen ellenkezőleg, az együttes előfordulásokat és a versengést ökológiai törvények (verseny, szimbiózisok, trofikus láncok) szabályozzák. Mint sok más tulajdonságnál, az emberek is nagyon hasonlóak, de egyedülállóak, amikor mikrobiotájukról van szó. Ha a megfelelő eszközöket választjuk, akkor minden egyént felismerhet a mikrobiája. Ugyanakkor kevés olyan mikroorganizmust ismerünk fel, amely a legtöbb egészséges emberben közös, és amelyek mikrobiális "magot" és mikrobiotarendszereket alkotnak, amelyek hasonlítanak egymásra, amelyeket "enterotípusoknak" neveznek, és amelyekről még mindig tárgyalnak. [1, 2]. Molekuláris eszközök a mikrobiota (sok molekuláris szonda) tanulmányozására egyes phylákat, másokat mikrobiális nemzetségeket, más fajokat azonosítanak, sőt vannak törzsspecifikus próbák is. A tömeges szekvenálás megközelítései a taxonómia ezen különböző szintjein nyújtanak profilt. Nagyon sok lehetőséget kínálnak a kutatók számára az ökoszisztéma feltárására, de igaz, kissé bonyolítja a klinikusok munkájának megértését (lásd az I. táblázatot).
A mai napig ezeket az ismereteket nem használják a mindennapi klinikai gyakorlatban, és az érvényesített ökológiai leírási eszközök csak a kutatók számára állnak rendelkezésre. A kvalitatív vagy kvantitatív mikrobiota mérések ("mikrobiális profilok") forgalomba hozott ajánlatai egyelőre nem értelmezhetők kellően megbízható módon, és nem validált szabványokon és referenciákon alapulnak, amelyek garantálják azok reprodukálhatóságát és összehasonlíthatóságát.
Hasonlóképpen, a mikrobiota (például rövid szénláncú zsírsavak) széklet metabolitjainak mérési eredményeit (többek között) annyira befolyásolják a mintavétel és az extrakció körülményei, hogy a kereskedelmi készletek értelmezése leggyakrabban nagyon műtárgy (nem használja a kínált készleteket).
Ismerje az eubiosis és a dysbiosis fogalmait
A gazdaszervezet általában jó összhangban él mikrobiotájával, amelynek funkciói (a kompozíció által hordozva) kedvezőek számára (eubiózis). A megbetegedések során megfigyelhetők a mikrobiota összetételében fellépő rendellenességek (kezdetben a diszbiózis kifejezést használták rájuk), igazolva a kutatást annak megállapítására, hogy diagnosztikai vagy prognosztikai hasznuk (bioindikátorok) vagy akár patogén jelentőségük lehet-e [1]. A diszbiózis során háromféle összetételi rendellenesség létezik: a kórokozók túlzott mértéke (potenciálisan káros mikroorganizmusok), a hasznos mikroorganizmusok hiánya és az ökoszisztéma szerkezetének elvesztése (különös tekintettel a biológiai sokféleség és/vagy a mikrobák gazdagságának korlátozására). A kórokozó puszta jelenléte nem elegendő a dysbiosis meghatározásához, és vannak például a toxint szekretáló Clostridium difficile vagy Salmonella egészséges hordozói.
A biodiverzitás és a mikrobiális gazdagság olyan ökológiai jellemzők, amelyek általában kedvezőek az ökoszisztéma stabilitásának fenntartása szempontjából, mivel zavarás esetén elősegítik annak ellenállását és rugalmasságát (az előző állapotba való visszatérést). Éppen ellenkezőleg, a dysbiosis során általában instabilitás, alacsony biológiai sokféleség és mikrobiális szegénység figyelhető meg. Az összetételen és felépítésen alapuló kezdeti meghatározás után jelenleg úgy gondolják, hogy a diszbiózis a mikrobiota-gazda szimbiózis lebontása [1, 3].
A mikrobiota összetételének bizonyos eltérései, amelyek betegségekhez vagy helyzetekhez kapcsolódnak, annyira jellemzőek, hogy használhatjuk az aláírások kifejezést. Közel állunk az ilyen aláírások felismeréséhez az IBD-ben és az elsődleges szklerotizáló cholangitisben [4, 5]. Mint minden bio-indikátor jelölt esetében, ezeket az aláírásokat érvényesíteni kell a beteg és egészséges alanyok független populációin, és meg kell vizsgálni a betegség megkülönböztetésének képességét a klinikus számára értelmes kóros helyzetekkel szemben. Várjuk például, hogy az aláírások segítenek-e megkülönböztetni a tiszta vastagbél Crohn-kórt az UC-től anélkül, hogy a tanulmány eredményeit nehezen értelmezné a Crohn-betegségben szenvedő alanyok vékonybélben való jelenléte.