A ClpB fehérje (kazeinolitikus peptidáz B) azonosítása, a neuropeptid utánzata

összefoglaló

Fegyelmezett

Kísérleti/sejtes és molekuláris mechanizmusok.

clpb

Bevezetés és a tanulmány célja

Elhízásban vagy anorexiában szenvedő betegeknél a bél mikrobiotájában (vagy dysbiosisában) számos változást azonosítottak. Valójában kimutatták, hogy megnövekedett a rendhez tartozó népesség Enterobacteriaceae és különösen a törzs Escherichia coli étvágytalanságban. Ez a növekedés fordítottan korrelált a testtömeg-indexdel. Így az Enterobacteriaceae kulcsszerepet játszhat az étkezési rendellenességek és az elhízás kialakulásában és/vagy fenntartásában. A legújabb tanulmányok kimutatták, hogy a törzs Escherichia coli K12 (E. coli) az Enterobacteriaceae-hez tartozó fehérje képes az α-MSH anorektikus neuropeptiddel (α-melanocita stimuláló hormon): a ClpB (kazeinolitikus proteáz B). A vizsgálat célja megerősíteni a ClpB expresszióját egy másik enterobaktérium törzsben, Hafnia alvei 4597 LC-MS/MS proteomikus megközelítéssel,adatfüggetlen megszerzés”(DIA).

Anyag és módszerek

Ehhez a tanulmányhoz a H. alvei 4597 és E. coli K12 használva voltak. Csak az a-MSH-val hasonló szekvenciájú fehérjék kimutatására anti-α-MSH antitesttel immunprecipitációt hajtottunk végre, majd LC-MS/MS DIA technikát hajtottunk végre. A kapott adatokat a Spectronaut Pulsar 11 szoftver (Biognosys) segítségével elemeztük, és az eredményeket kereszthivatkoztuk a ’E. coli (UniProt TrEMBL, 83333) és ’H.alvei (UniProt TrEMBL, 13337) a fehérjék azonosítása céljából. Csak a fehérjék Q-érték 0,001 és egy log2-szeres változás > 0,4-et vettünk figyelembe ebben a vizsgálatban.