Coronavirus 2019-nCoV Romániai Mikrobiológiai Társaság

Szerző: Prof. Dr. Simona Ruță, Carol Davila, UMF, „Ștefan S Nicolau” Virológiai Intézet

Új, koronavírust, ideiglenesen 2019-nCoV néven, súlyos emberi légúti fertőzésekkel társítva, 2020 januárjában azonosítottak Wuhanban, a kínai Huabei tartományban. 2019. december 31-én 44 atípusos tüdőgyulladás kitörését jelentették a WHO-nak, de 2019. december 1. óta kórházi esetek voltak.

2020. február 2-ig Kínában több mint 14 500 megerősített esetről és 304 halálesetről számoltak be, valamint Ázsia, Ausztrália, Európa és Észak-Amerika további 23 országában 146 esetről 1 halálesettel. A számok napról napra gyorsan változnak, és a Lancet-ben publikált, matematikai modellezésen alapuló tanulmány több mint 78 000 esetet vetít előre, exponenciális növekedéssel Kína több nagyvárosában, 1- 2 héttel a Wuhan-ügyektől el, magas a globális terjedés kockázata erőteljes átvitel-enyhítő intézkedések és járványcsúcs hiányában 2020 első felében.

Az új 2019-nCoV koronavírust kezdetben NGS szekvenálással azonosították (Illumina és Nanopore kombinációjával), és Kínában izolálták az emberi légzőszervi hámsejtek primer tenyészetein. Korábban két másik, valószínűleg denevérekből származó zoonózisos koronavírus súlyos légúti járványokat okozott:

A SARS-CoV (súlyos akut légzőszervi szindróma Cov), amelyet 2002-ben azonosítottak Kína déli részén, a Gunagdong régióban, és amely gyorsan elterjedt világszerte, és 2004-es eltűnéséig több mint 8000 embert és 774 halált okozott (9,5% -os halálozás);
A Szaúd-Arábiában 2012-ben azonosított, 27 országban elterjedt MERS CoV (közel-keleti respirációs szindróma koronavírus), amely továbbra is a Közel-Keleten kering, és eddig 2521 esetet és 919 halált eredményezett (35% -os halálozás), emésztőrendszeri tünetekkel és akut veseelégtelenséggel is társul.

Terjedés
A CoV-ben 2019 által okozott kezdeti esetek többsége élő állatokkal, egzotikus állati hússal és friss tenger gyümölcseivel foglalkozó helyi piachoz kapcsolódott [19, 20], amely a vírus zoonózisos átvitelét javasolta egyik fajról a másikra. ismeretlen. Jelenleg azonban Kínában tartós az emberközi légzésátvitel, és más országokban is előfordult néhány emberközi átadás. Egyes jelentések azt mutatják, hogy a vírus az inkubáció alatt álló emberektől is átvihető (amelynek időtartamát 2,5-9 napra becsülték). Az enyhe, nem kórházi fertőzések tényleges aránya még nem ismert, de úgy tűnik, hogy lehetnek tünetmentes fertőzések, amelyek átadása nem valószínű. A MERS CoV gyakran tünetmentes fertőzéseket okozott, míg a SARS CoV szinte soha.

Úgy tűnik, hogy a három zoonotikus koronavírus közül egyik sem fertőző, az R0 szaporodási arány 2,4-2,68-ra becsülhető 2019 nCoV esetében. A légzés átvitele a Pfluge cseppeken vagy fomitokon keresztül domináns mind a 3 zoonózisos koronavírus esetében. A SARS CoV és a MERS CoV esetében a másodlagos átvitel főleg kórházi intra, az orvosi eljárások, például az endotrachealis intubáció, a bronchoszkópia, az aeroszolizált gyógyszerek beadása során keletkező aeroszolok elősegítették a betegség terjedését.

Mind a SARS-ban, mind a MERS-ben léteztek úgynevezett „szupersúlyosok”, akik a vírus nagyon magas szintjét megszüntették, és lenyűgöző számú másodlagos esetet generáltak. A SARS esetében a lehetséges bélsár-szájon átterjedést is kiemelték, a bőséges, vizes hasmenéssel járó esetek közül. Egy hongkongi lakótelepen (Amoy Garden) nem kevesebb, mint 300 SARS-esetet regisztráltak, amelyet egy hasmenéses beteg továbbított, aki szennyezte az épület csatornáját, a vírust a fürdőszobák csatornáiból izolálták.

Eredet
Genomikai elemzés azt mutatta, hogy a 2019-nCoV egy különálló béta-koronavírus a SARS CoV és a MERS CoV koronavírusoktól. Mindhárom zoonotikus koronavírus denevérként rendelkezik tározóként, de különböző fajokból származnak, és egy köztes gazdán keresztül jutnak el az emberhez. A 2019-nCoV esetében még ismeretlen, míg a SARS CoV esetében cibet (tenyér cibet), a MERSCoV esetében pedig teve képviseli. A filogenetikai elemzések azt mutatják, hogy a 2019-nCoV nemrégiben került bevezetésre az emberi populációban, valamint a korábban Yunnan tartomány denevérjeiből izolált koronavírussal (BatCoV RaTG13) való rokonság, amelyhez genetikai hasonlóság 96,3% -os.

A genom egészére kiterjedő szekvenálási eredmények azt mutatják, hogy a 2019-nCoV elkülönült klád a denevérek egyéb SARS-szerű koronavírusaitól, és nem rekombináns más emberi vagy állati koronavírusok között, amint azt a vírusos glikoprotein szekvenciák elemzésén alapuló előzetes vizsgálatok sugallják.

Sejtes receptorok
A SARS CoV az alsó légúti hámsejtekben jelen lévő ACE II metallopeptidázt (angiotenzin 2 konvertáló enzimet) alkalmazza, amely megmagyarázná a betegség során bekövetkezett jelentős késői vírusürülést (10 napos megjelenés után) és a kórházi átvitel gyakoriságát., aeroszolképző eljárásokkal. Néhány előzetes tanulmány azt javasolja, hogy ugyanazt a receptort alkalmazzák 2019 nCoV-ig.
A MERS Cov egy különálló receptort, egy dipeptidil-peptidáz-DPP4-et (CD26) használ, amely megtalálható az alsó légúti traktusban, különösen az alveoláris hámsejteken, de más szövetekben is, ami megmagyarázná a légúti tünetek és a gyomor-bélrendszeri és akut veseelégtelenség. Számos tanulmány vizsgálta ennek a molekulának a túlzott expresszióját társbetegségekben (elhízás, asztma), egyidejű vírusfertőzésekben és dohányosokban, akiket a betegség súlyos kialakulásának veszélyeztetettnek tartanak.

Az új koronavírus fertőzésének diagnózisa jelenleg a vírus nukleinsavának valós idejű PCR-en történő kimutatásán alapul, nasopharyngealis exudátumban, brohoalveolaris mosásban vagy tracheobronchialis aspirátumban. A szükséges protokollokat és reagenseket a WHO és az USA CDC-n keresztül szerezhetjük be. Hamarosan elvégezhetők az anti-2019-nCoV antitestek detektálási tesztjei, amelyek lehetővé teszik a fertőzés szeroprevalenciájának értékelését és a tünetmentes fertőzések kiemelését. A közelmúltban a 2019-nCoV-t izolálták sejttenyészeteken Ausztráliában, a melbourne-i Peter Doherty Infekciós és Immunológiai Intézetben. A laboratórium, amely Kínán kívül elsőként szerzett vírustörzset egy pácienstől, együttműködik a WHO-val, hogy az izolátumot más referencia központokba terjessze.

Zoonózisos koronavírus fertőzések kezelése
Jelenleg a kezelés tüneti és támogató, etiológiai kezelés nincs. Kísérletileg számos széles spektrumú vírusellenes gyógyszert tesztelnek koronavírus fertőzésekre, köztük a 2019-nCoV.
A MERS CoV fertőzés esetében a béta-interferon és a proteáz-inhibitor kombinációját (lopinavir és farmakológiai fokozó - ritonavir kombinációja - a HIV-fertőzésben gyakran alkalmazott formula) tesztelik egy klinikai vizsgálatban (MIRACLE) Szaúd-Arábiában, in vitro. Az állatmodell-vizsgálatok kimutatták, hogy a vírus RNS-polimeráz inhibitora - a remdesivir kiemelkedő hatást fejt ki, ami javítja a tüdő működését, és csökkenti mind a vírus terhelését, mind a tüdőkárosodást.

Korábban a SARS CoV és a MERS CoV által okozott járványok idején megfigyelési vizsgálatok kimutatták néhány kapcsolódó klinikai hasznot: passzív immunprofilaxis a meggyógyult betegek plazmájának beadásán alapul; a PEG IFN alfa és a ribavirin együttes alkalmazása, nagy dózisú kortikoszteroidok és interferon alfacon-1 együttes alkalmazása. Számos hagyományos kínai gyógyszert alkalmaznak empirikusan. A kémiai vegyület könyvtárak és adatbázisok folyamatos szűrése a hatékony vírusellenes potenciál megtalálása érdekében.

megelőzés
Jelenleg nincs koronavírus elleni vakcina. Az előzetes vizsgálatokat a SARS CoV járvány alatt végezték, de a vírus eltűnése után felhagytak. Számos oltóanyagjelöltet állítanak össze és tesztelnek mind a gyógyszergyárak, mind az amerikai NIH, valamint a globális Cepi szövetség (az állami, magán, filantróp és civil társadalmi szervezetek közötti partnerség) által finanszírozott tanulmányokban az innováció érdekében. járványra való felkészültség.

Közegészségügyi intézkedések
A WHO január 30-án nemzetközi közegészségügyi vészhelyzetnek nyilvánította az új koronavírus 2019-nCoV által generált járványt. Ez jelzi a gyorsan összehangolt nemzetközi válasz szükségességét, különösen az esetek felhalmozódásának megakadályozása érdekében a korlátozott forrásokkal rendelkező régiókban. Az árukra és az emberekre nem vonatkoznak forgalomkorlátozások, de várhatóan minden ország elvégzi az ilyen intézkedések kockázat-haszon elemzését. Minden országnak fel kell készülnie az aktív megfigyelésre, a korai felismerésre, az elszigetelésre és az esetkezelésre, a kapcsolattartók azonosítására és a 2019-es nCoV-fertőzés további terjedésének megakadályozására, és együtt kell működnie a WHO-val.
Korábban Kína teljes karantént vezetett be több metropolisz (> 54 millió ember) számára, az első Wuhan, a 11 millió lakosú város volt, ahol először diagnosztizálták a fertőzést. Január 23-án mind a város tömegközlekedését, mind a Wuhanból indított légi és vasúti forgalmat felfüggesztették az új koronavírus terjedésének megakadályozása érdekében.

Számos ország beutazási tilalmat vezetett be az új koronavírus átterjedésének kockázatának kitett emberek számára. Ezek az intézkedések akkor indokoltak, ha figyelembe vesszük a 2003–2004 közötti SARS-járvány kialakulásának módját, amely példát jelent arra, hogy mit jelent egy feltörekvő vírus a globalizáció, a túlzott urbanizáció, túlzsúfoltság és nagy mozgási sebesség mellett.

A SARS-t 2003. február végén ismerték fel, miután Kínában 2002 novembere óta fertőzéseket diagnosztizáltak, de a WHO-val nem jelentették. A betegség szárazföldi Kínán túli terjedésének indexes esete egy 65 éves orvos volt, aki Guangdongban SARS-betegeket gondozott. 2003. február 21-én egy hongkongi szállodában tartózkodott, 6 nappal ezelőtt kezdődött légzőszervi megbetegedés jeleit mutatva. Egészsége gyorsan romlott, egy nappal később kórházba került, március 4-én halt meg.

Másodlagos esetek sora fordult elő a kórházban, és 17 ember, aki kapcsolatba lépett a szálloda indexes páciensével, megfertőződött, kiváltva a hongkongi járványt. Néhányan Vietnamba, Szingapúrba és Torontóba utaztak, ahol a helyi járványok forrásává váltak. 2003. február 28-án influenzaszerű tünetekkel járó beteget vettek fel a vietnami Hanoi kis magánkórházába; Az orvosi személyzet 60 tagja megbetegszik. Dr. Carlo Urbani, a WHO regionális tisztje gyorsan bevezetett egy teljes kórházi karantént, ezzel korlátozva a betegség terjedését, és figyelmeztette a WHO-t az új szindrómára. Ő maga a kórházban maradt március 11-ig, amikor a thaiföldi Bangkokba utazott; a repülés során tüneteket okoz, elszigeteli magát a repülőtéren és 18 nap után, 2003. március 29-én meghal. 2003. március 12-én a WHO kiadott egy globális közegészségügyi riasztást, három nappal később pedig a az új szindróma vizsgálata, amely azonosítja a SARS CoV-t.

Szelektív Irodalomjegyzék
Az új koronavírusnak szentelt külön oldalt az
New England Journal of Medicine - https://www.nejm.org/coronavirus
Lancet https://www.thelancet.com/coronavirus
WHO https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019
CDC https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-nCoV/index.html
ECDC https://www.ecdc.europa.eu/en/geographic-distribution-2019-ncov-cases

A legfontosabb cikkeket az alábbiakban említjük, és a publikálás gyorsaságáról véleményt tett közzé: Rubin EJ, Baden LR, Morrissey S, Campion EW. Orvosi folyóiratok és a 2019-nCoV járvány. N Engl J Med. 2020 január 27. doi: 10.1056/NEJMe2001329. [Epubahead of print] PubMed PMID: 31986242

Szigetelés 2019-nCoV

Zhu N, Zhang D, Wang W, Li X, Yang B, Song J, Zhao X, Huang B, Shi W, Lu R, Niu P, Zhan F, Ma X, Wang D, Xu W, Wu G, Gao GF, Tan W; Kínai regény koronavírus-kutató és kutatócsoport. Egy új koronavírus tüdőgyulladásos betegekből Kínában, 2019. N Engl J Med. 2020 január 24. doi: 10.1056/NEJMoa2001017. [Epub a nyomtatás előtt] PubMed PMID: 31978945.
Chan JF, Kok KH, Zhu Z, Chu H, KK, Yuan S, Yuen KY. Az atipikus tüdőgyulladásban szenvedő páciensből izolált, 2019-es új, emberi patogén koronavírus genomikus jellemzése Wuhan látogatása után. A sürgősségi mikrobák megfertőznek. 2020 december; 9 (1): 221-236. doi: 10.1080/22221751.2020.1719902. PubMed PMID: 31987001.
Chen Y, Liu Q, Guo D. Feltörekvő koronavírusok: genomszerkezet, replikáció és patogenezis. J Med Virol. 2020 január 22. doi: 10.1002/jmv.25681. [Epub nyomtatás előtt] Review. PubMed PMID: 31967327.

A járvány alakulása

Fertőző klinika

Huang C, Wang Y, Li X, Ren L, Zhao J, Hu Y, Zhang L, Fan G, Xu J, Gu X, ChengZ, Yu T, Xia J, Wei Y, Wu W, Xie X, Yin W, Li H, Liu M, Xiao Y, Gao H, Guo L, XieJ, Wang G, Jiang R, Gao Z, Jin Q, Wang J, Cao B. 2019 új koronavírusával fertőzött betegek klinikai jellemzői Wuhanban, Kínában. Gerely. 2020 január 24. pii: S0140-6736 (20) 30183-5. doi: 10.1016/S0140-6736 (20) 30183-5. [Epub a nyomtatás előtt] PubMed PMID: 31986264.
Chan JF, Yuan S, Kok KH, To KK, Chu H, Yang J, Xing F, Liu J, Yip CC, Poon RW, Tsoi HW, Lo SK, Chan KH, Poon VK, Chan WM, Ip JD, Cai JP, Cheng VC, Chen H, HuiCK, Yuen KY. A 2019-es új koronavírushoz társuló tüdőgyulladás családi klasztere, amely személyről emberre utal: egy családi klaszter vizsgálata. Gerely. 2020 január 24. pii: S0140-6736 (20) 30154-9. doi: 10.1016/S0140-6736 (20) 30154-9. [Epub a nyomtatás előtt] PubMed PMID: 31986261.

A vírus és a sejtes receptorok eredete

Corman VM, Landt O, Kaiser M, Molenkamp R, Meijer A, Chu DK, Bleicker T, Brünink S, Schneider J, Schmidt ML, Mulders DG, Haagmans BL, van der Veer B, van den Brink S, Wijsman L, Goderski G, Romette JL, Ellis J, Zambon M, Peiris M, Goossens H, Reusken C, Koopmans MP, Drosten C. A 2019-es regénykoronavírus (2019-nCoV) kimutatása valós idejű RT-PCR-rel. Euro Surveill. 2020 január; 25. (3). doi: 10.2807/1560-7917.ES.2020.25.3.2000045. PubMed PMID: 31992387.

A SARS és a MERS járvány története