Az emberi genom változékonysága A betegségkutatás jelentősége
Cichon, Sven
Összegzés
Az emberi genom nagyrészt szekvenálva van, és körülbelül 30–40 000 gént azonosítottak. Ez fontos lépés az emberi test molekuláris biológiai folyamatainak jobb megértése érdekében. A betegségek örökletes okainak tisztázása szempontjából egy másik szempont nagyon fontos: az örökletes információk egyéni különbségeinek ismerete, a genetikai variabilitás. Ez jelenti azt a kulcsot, amellyel azonosíthatók azok a genetikai különbségek, amelyek megváltoztatnak bizonyos fiziológiai folyamatokat, és így hozzájárulnak a betegségek kialakulásához. A munka áttekintést nyújt az emberek genetikai változatosságának különböző formáiról, azok gyakoriságáról és eloszlásáról. Hozzájárulhat a genetikai variabilitás fontosságának megértéséhez a betegségkutatás szempontjából.
Kulcsszavak: genetikai variabilitás, emberi genom projekt, génszekvenálás, molekuláris biológia, génmutáció
Összegzés
Az emberi genom változékonysága és relevanciája az orvosi kutatás szempontjából
Elkészült az emberi genom vázlata, és körülbelül 30-40 000 gént azonosítottak. Ez a tudományos fejlődés mély hatással van az emberi szervezet működését irányító biológiai mechanizmusok megértésére. Egy új dimenzióval bővül az emberi genom azáltal, hogy feltárjuk az egyének közötti változékonyságot. A genetikai variabilitás ismerete lesz a legfontosabb erőforrás a megváltozott fiziológiai folyamatokhoz vezető genetikai különbségek és ennek következtében a betegség kialakulásához. Ez a kézirat a változékonyság osztályainak jelenlegi ismereteit vizsgálja fel,
relatív gyakoriságok és a genom egészére kiterjedő eloszlások.
Kulcsszavak: genetikai variabilitás, emberi genom projekt, génszekvenálás, molekuláris biológia, génmutáció
Benyújtott kézirat: 2002. augusztus 13, elfogadás: 2002. augusztus 28
Hogyan idézzük ezt a cikket:
Dtsch Arztebl 2002; 99: A 3091-3101 [46. kiadás]
A zárójelben szereplő számok az irodalomjegyzékre utalnak, amely a szerző kiadásában és az interneten elérhető (www.aerzteblatt.de).
Cím a szerzőknek:
Dr. rer. nat. Sven Cichon
Orvosi Genetikai Osztály
Antwerpeni Egyetem
Universiteitsplein 1, 2610 Antwerpen, Belgium
E-mail: [email protected]
További információ az interneten:
www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/index.html
www.ensembl.org/
Allele
A variábilis (polimorf) DNS-szekvencia bizonyos expressziója a genomban. A variáns vagy szekvenciaváltozat kifejezéseket az allél szinonimájával is használjuk. Az egy nukleotid polimorfizmusok (SNP) a populációban általában két alléllal rendelkeznek, míg a mini és a mikroszatelliteknél tíznél több allél lehet.
Genetikai lokusz
Pozíció a genomban, ahol egy bizonyos genetikai szekvencia vagy bizonyos genetikai információ található. A lokusz lehet például egyetlen bázis helyzet, mikroszatellit, gén vagy citogenetikus sáv.
Polimorfizmus
Eredetileg genetikai lokuszként definiálták, amelynek számos allél létezik, és a populációban a ritkább allél allélgyakorisága legalább egy százalék. Ennek a határnak meg kell különböztetnie a semleges variánsokat a kedvezőtlen hatású mutációktól, de homályos. Az orvosi genetikában a polimorfizmust gyakran használják a genom egy változó pontjának leírására, amely fenotípusos hatások nélkül marad.
A cikkben a polimorfizmus kifejezést általában azokra a DNS-szekvenciákra használják, amelyek két vagy több allél léteznek a populációban, vagyis függetlenek az allél gyakoriságától és a fenotípus hatásától. Ebben az összefüggésben a polimorfizmus kifejezés megfelel az angol szekvenciaváltozat kifejezésnek, amelyet egy új nomenklatúra részeként javasoltak a szekvencia-különbségek semleges leírására (den Dunnen és Antonarakis, Hum Genet 2001; 109: 121-124).
Genetikai marker
Polimorfizmus, amelynek pontos kromoszómális helyzete ismert, és amelynek különböző alléljei viszonylag gyakoriak a populációban.
mutáció
Örökletes változás a DNS-ben az egyénben. Szekvencia eltérés van a vad típustól vagy a referencia szekvenciától. A mutáció típusai: egyetlen bázis cseréje (pontmutáció), egy vagy több bázis elvesztése (törlés), egy vagy több bázis beillesztése (inszerció), szekvencia darab duplikálása (duplikáció), egy szekvencia darab bázis szekvenciájának megfordítása (inverzió). A mutáció kifejezés a szekvencia megváltoztatására használható, tekintet nélkül azok fenotípusos hatására. Az orvosi genetikában azonban leginkább fenotípusos következményekkel járó szekvenciaváltozásokra használják (különösen azokra, amelyek betegséget okoznak).