SARS-CoV-2 Medlife CORONAVIRUS VIZSGÁLAT
Szerző: Dr. Vasilescu Roxana, a bukaresti MedLife Grivita laboratórium főorvosa
SARS-CoV-2 (Súlyos akut légzőszervi szindróma, a koronavírus 2) a Coronaviridae családba tartozik, a béta-koronavírus csoportba.
koronavírusok burkolt vírusok, egyszálú RNS típusúak, nagy méretűek, körülbelül 125 nm-esek. A vírusgenom 16 nem strukturális fehérjét és 4 strukturális fehérjét kódol.
Az utóbbiak: protein S (tüske), E fehérje (burok), M fehérje (membrán) és protein N (nukleokapszid).
Számos koronavírus (HCoV-229E, HCoV-NL63, HCoV-HKU1, HCoV-OC43) enyhe endémiás légúti állapotokat okoz a gyakori "megfázás" vagy "gyakori légzőszervi vírusok" csoportjában. Két másik koronavírus súlyos légúti járványokat okozott. Ez körülbelül:
• A SARS-CoV 2002-ben azonosult Kína déli részén, a gyorsan terjedő globális Gunagdong régióban, és amely 2004-es eltűnéséig több mint 8000 emberi esetet és 774 halált okozott (9,5% -os halálozás) és
• A 2012-ben Szaúd-Arábiában azonosított, 27 országban elterjedt és a Közel-Keleten még mindig keringő MERS-CoV (közel-keleti légúti szindróma koronavírus), amely eddig 2521 esetet és 919 halálesetet (halálozás 35 %), társítva a gyomor-bélrendszeri tüneteket és az akut veseelégtelenséget.
Úgy tűnik, hogy ezeknek a vírusoknak a természetes tározója denevér populáció. Embereknél egy közbenső gazda útján terjednek. Ha a SARS-CoV és a MERS-CoV esetében ez a köztes gazda ismert (cibet, illetve teve), akkor a SARS-CoV-2 esetében még mindig nem lehet pontosan meghatározni.
SARS-Cov-2 a világon és Romániában
2019 végén egy új koronavírust azonosítottak a tüdőgyulladás kitörésének okaként Wuhanban - a kínai Hubei tartomány egyik városában. Gyorsan elterjedt, és járványhoz vezetett egész Kínában. Március 11-én a WHO koronavírus-járványt hirdetett. Az első Romániában megerősített eset február 26-án történt egy Gorj megyei férfival szemben. Március 16-án rendkívüli állapotot hirdettek Romániában, március 22-én pedig a COVID-19 első halálát jelentették Romániában. A mai napig a SARS-CoV-2-vel fertőzött emberek halálozása Romániában 5,6% körül mozog, összehasonlítva az országban végzett vizsgálatok szintjével.
A SARS-CoV-2 egy COVID-19 nevű légúti fertőzést (Coronavirus fertőző betegség - 2019) okoz, átlagos inkubációs periódusa körülbelül 5 nap (a határok 2-14 nap). A betegséget túlnyomórészt intenzív légzőszervi tünetek (láz, köhögés, légzési nehézségek) jellemzik az esetek körülbelül 80% -ában, de súlyos megnyilvánulásai lehetnek (bilaterális interstitialis tüdőgyulladás), légzési elégtelenséggé, akut légzési distresszé (ARDS) progrediálva a halál legfőbb oka. Vannak olyan esetek is, amelyek emésztőrendszeri megnyilvánulásokkal (különösen hasmenéssel) járnak, egyes betegeknél (főleg fiataloknál) korai tünetekként hypo/anosmia (szagvesztés) és hypo/dysgeusia (ízvesztés) beszámoltak.
Hogyan kell tesztelni?
A COVID-19 specifikus diagnózisának referencia tesztje NAAT technológiával történik (nukleinsav-amplifikációs technológia), ill. reverz transzkripció valós idejű PCR (qRT-PCR).
Ez a teszt feltárja a vírusos RNS jelenlétét az orrgaratban; más szóval igazolja a vírus jelenlétét.
Szerológiai vizsgálatokat végeznek a véren, és antivírus antitestek (SARS-CoV-2) jelenlétét mutatják, amelyek a gazdaszervezet immunválaszát képviselik a vírus jelenlétére. Ezek az antitestek az A, M, G, ritkán D osztályba tartozó immunglobulinok.
Korábbi modellek vírusfertőzésekre adott szerológiai antitest típusú válaszokat állapítottak meg, általában véve, ezen antitestek következő szekvenciája a vírusfertőzés időpontjától kezdve:
• a legkorábbi az IgA,
• kövesse szorosan az IgM-et,
• Az IgG antitestek utoljára jelennek meg és maradnak magas titerekben hosszabb ideig, mint az előzőek (IgA és IgM).
Egyes vírusok esetében van egy periódus, amelyben az antigén (maga a vírus) együtt él (azonosítható) antitestekkel, különösen a korai IgA és IgM antitestekkel. Más vírusok periódusa "szerológiai ablak", azaz időintervallum az antigén eltűnése (a vérben) és az antitestek megjelenése között, tehát olyan időintervallum, amelyben a fertőzés nem mutatható ki (elmúlt).
Az IgG antitestek késői antitestek, amelyek általában az antigén eltűnése után jelennek meg. A vérben hosszú ideig tartó IgG antitesteket a legtöbb vírus esetében védő antitestnek tekintik; ha ugyanazon vírussal új fertőző kapcsolat lép fel, vagy a vírust azonnal semlegesítik, és nem kezd el lokalizálódni és szaporodni sejtszinten, vagy megkezdődhet a szaporodási ciklus a gazdasejtben, de annak hatása (tehát a betegség tünetei ) sokkal alacsonyabbak, mint az elsődleges fertőzésnél.
Amit a kutatók mondanak a szerológiáról?
Jelenleg a szervezet SARS-CoV-2 fertőzésre adott specifikus immunválasza számos országban tanulmányozás tárgyát képezi. A mai napig nincs teljes hiteles információ mind az antitestek dinamikájáról a fertőzés időpontjára, mind pedig azok víruseltávolítási és semlegesítő képesség utáni perzisztenciájáról, így a SARS-CoV- 2. A legtöbb publikált tanulmány az antitestdinamika vonatkozásában referenciaként használja a tünetek megjelenését, nem pedig a fertőzés időzítését. Európai szinten még folynak a lakosságra vonatkozó vizsgálatok a szeroprevalencia megállapítására, amelyek közegészségügyi szempontból hasznosak a fertőzések elleni védekezésben, és megértik a tünetmentes fertőzések fontosságát.
A SARS-CoV-2 fertőzés utáni immunitásról még mindig hiányos információk függvényében a szerológiai tesztek hasznosak lehetnek olyan személyek azonosításában, akiknél immunválasz alakult ki, aktív fertőzés részeként vagy egy korábbi fertőzés eredményeként. A szerológiai vizsgálatok eredményei különösen fontosak a tünetmentes vagy tünetmentes fertőzések diagnosztizálásában. Bár a fertőzés utáni immunitásról még nem állnak rendelkezésre teljes információk, a szerológiai adatok azonosíthatják azokat az alanyokat, akik már nem hajlamosak a fertőzésre. Hasznos lehet a potenciális plazma donorok azonosítására is, amelyek felhasználhatók súlyos formák kezelésében.
Ezenkívül a szerológiai vizsgálatok segíthetnek az aktív fertőzés diagnosztizálásában, ha az RT-PCR negatív a COVID fertőzés késői fázisában jelentkező
Az RT-PCR-rel kombinált szerológia szintén növeli a SARS-VOC-2 fertőzés kimutatási arányát 98,6% -ra.
A szerológiai vizsgálatoknak azonban számos korlátja van. A negatív szerológiai eredmények nem zárhatják ki a SARS-COV2 fertőzést, különösen akkor, ha a fertőzés nemrégiben fordult elő. Másrészt fennáll a pozitív eredmények kockázata a más koronavírusok fertőzésének eredményeként képződött antitestekkel való keresztreakció miatt. A szerológiai módszer akkor tekinthető validáltnak, ha olyan eredményeket hoz, amelyek helyesen azonosítják az antitestek jelenlétét vagy hiányát, előre meghatározott statisztikai megbízhatósági szinten.
Bár számos immunológiai teszt kereskedelemben kapható, a diagnózis és az optimális felhasználás pontosságának fenntartva kell maradnia, várva az idő tesztjét.
IgG antitestek a MedLife ellen
Az Abbott analitikai rendszeren végzett IgG és IgM antitest tesztek kvalitatív szerológiai tesztek, amelyek mikrorészecske kemilumineszcencián (CMIA) alapulnak. Anti-SARS-CoV-2 vírusos nukleokapszid antitesteket detektálnak. A vírusos nukleokapszidban található N-fehérje a leggyakoribb, immunogén és jól megőrzött víruskomponens, amelyet jó diagnosztikai markernek tekintenek.
Az IgG antitestek esetében a teszt teljesítmény kritériumai a következők:
Pozitív jóslat (31 alany 122 mintája megerősítette a PCR-t):
• • 3 - 7 nap a tünetek megjelenésétől számítva: 25,00%
• 8 - 13 nap a tünetek megjelenésétől számítva: 86,36%
•> = 14 nap a tünetek megjelenésétől számítva: 100,00%
Negatív előrejelzés (997 szérum, 2019. szeptember, + 73 minta légzési tünetekkel rendelkező betegekről, negatívan tesztelték a PCR-t az nCOV szempontjából)
• nCOV-negatív betegek mintái: 100,00%
Keresztreaktivitási vizsgálatok: 182 minta megerősített betegből, 36 különböző fertőző betegségben
• 181 minta negatív volt az nCOV szempontjából
• CMV IgG-ben szenvedő betegek 5 mintájából 1 pozitív volt